平凡な高校生の深町晶はふとしたことから奇妙なカプセルを拾ってしまう。中から飞び出してきた怪异な物体に包まれて川へと落下する晶。その傍ら、彼のガールフレンドである瀬川瑞纪に怪物や谜の男たちが迫った。だが川から现われた别の怪人が怪物=超獣化兵(ゾアノイド)を撃退。男たちの正体は秘密结社クロノスの一员で、カプセルは结社が作り出した人间を强化させる「ユニットガイバー」だった。ユニットガイバーで怪人=ガイバーIへ殖装(変身)する能力を得た晶。彼とクロノスの戦いが始まる……。 剧中に登场するもう一人のガイバーことガイバーIIは原作と异なり女性キャラクターへ変更。本作はOVAとして発売された同日に一部地域で剧场公开もなされている。